奥姆真理教的狰狞獠牙终于暴露了出来，也让日本政府清楚了，即使奥姆真理教跟病毒的爆发没有关系，但其性质已经危害了日本政府的统治，如果继续放任其壮大，有可能造成十分恶劣的影响。
仅京都府一地奥姆真理教的武装分子就上百人，他们有ak-47甚至rpg这样的军用武器，远远强于警方的火力。而且明显他们训练有素，懂得利用地形对警察进行有效的打击，而缺少真正巷战经验的警察，却被奥姆真理教的真理军打得七零八落，已经造成了几十人的死伤，使得日本极大震动。
首相细川护熙得知了这一情况后，做出了批示：“在国土上非法聚众，并私藏军用武器，公然对警务人员进行袭击，奥姆真理教已经严重危害了国家安全和社会稳定，构成了叛乱的罪行，我日本政府必将对其进行严肃处理！”
之前奥姆真理教毕竟是在日本合法的宗教法人，具有不能够否定和侵犯的传教和发展的权力，所以政府部门也没有对其太过注意。可是京都事件以后，当日本政府开始收集奥姆真理教的各种讯息的时候，才发现自己的国家中藏了一只怎样可怕的怪物。
奥姆真理教干下了大量为非作歹的事情，包括强制关押人口，对公民的暴力侵害，甚至还与一些化学武器泄露事故有关，而随着收集来的情报越来越多，日本政府更判断奥姆真理教组建了一个规模不清楚的武装力量，真理军，其心思不言而喻，就算是普通的雅库扎暴力团也不会大量购入这些武器，而真理军的武器甚至都包括装甲车和导弹。
京都事件只是一个警钟，等于明确告诉了日本当局，奥姆真理教已经发展到了不制止就可能酿成大祸的地步了。细川护熙果断地要对奥姆真理教进行取缔，也是看出了邪教的危害。
可是，日本社会废萌化虽然还有一段时间才能出现，但战后的日本基本就是一个畸形的大社会。除了复杂的官商勾结和政治家族体系之外，不同政治派系、不同职能的机构互相之间也存在着种种的矛盾，推诿扯皮时有发生。
就在细川护熙代表政府发表声明要取缔奥姆真理教的时候，扯后腿的就出来了。日本最高裁判所（也就是最高法院），和一部分法律界知名人士，纷纷站出来指责政府的僭越，他们认为奥姆真理教的宗教法人地位是确凿的，即便是要取缔，也跟政府没有什么关系，政府没有权力空口白牙地取缔奥姆真理教，在走司法程序、进行大量听证之前，奥姆真理教仍旧是日本的合法宗教，政府无权对其进行任何行动。
这还不是最牛逼的，最牛逼的来自自卫队。
细川护熙见奥姆真理教自己建立了武装，考虑普通的警力是不可能将其拿下的，于是将这个问题抛给了自卫队。而自卫队方面根本不听首相大人的招呼，陆上幕僚长，也就是陆上自卫队的指挥官，富泽晖，拒绝执行来自首相的命令，称当前情况埃博拉病毒疫情严重，大部分陆上自卫队的自卫官处于解散状态，一时难以召集，而且就算召集也可能带来巨大的染病风险，这是对自卫官们生命的轻视和不尊重。同时，陆上自卫队也对政府的指令高度质疑，奥姆真理教的定性尚未完成，陆上自卫队不会草率地对自己的同胞平民开枪。
这一幕像极了另一个位面福岛核危机的时候，日本首相菅直人命令自卫队前往灾区执行任务，而自卫队却像火烧屁股一样地迅速撤离，反正不管政府怎么恳求，自卫队还是抗命不尊，最终熬不住，就派了两架直升机在灾区撒了点水就立即走人。
自卫队方面不是不知道奥姆真理教组建了武装力量，而且对社会的治安与稳定产生了负面的影响，可是自卫队却不敢冒着把自卫官们聚集起来进行军事行动，而增加埃博拉病毒感染机会的风险。所以自卫队能够坐视奥姆真理教打日本政府的脸，而自己不采取任何的行动。
反观奥姆真理教一边，却因为京都事件的爆发，而进入了全面的整备过程中。教主麻原彰晃特地紧急召集了几位重要的核心干部，包括高桥克也、菊地直子、赫伯茨等人，共同商量大事。
“现在我教已经被官方给盯上了，只不过因为他们内部的倾轧，暂时还不会对我们形成太大的伤害，但是我们不能就此安心，日本政府早晚还是会对我们动手的，我们现在需要考虑的，是提早发动，还是再按下一段时间。提早发动虽然可以打日本政府一个措手不及，但是我们的力量还不够强大，真理军还有一部在国外受训，这时候也不可能迅速形成战力。而且我们的教众还在各地，有些甚至是刚发展起来的地方教会，组织尚不完善，太仓促与政府作对，我们将会面临严峻考验。”麻原彰晃在这些人面前不会充得太神棍，而是说出了自己的忧虑。
高桥克也向来颇有智计，此时道：“其实不管我们准备了多少，日本政府的力量总是大过我们的，而我们一旦真的起事，虽然会遭到日本政府的全面打击，但是对于我们更好宣传我们的教义和力量也有帮助。这几天随着报道，人们知道我们可能拥有解救埃博拉病毒的方法，寻找我们的基层教会企图加入我们教会的人变多了呢！人都是现实的生物，能够为他们提供安全的，他们才会跟随。”
菊地直子也道：“我们也要注意，不能让政府随意地对我们泼脏水，污蔑我们是邪教的，在舆论方面，我们必须有自己的门路，最少可以跟政府斗个旗鼓相当，不然一旦我们的形象负面化了，人们对于我们会增加不信任，还是难以加入我们！”
两员干将的发言，让麻原彰晃不住点头，不过他们还是没有说到底要不要全面起事，所以他又把目光看向了开发出埃博拉病毒疫苗的最大功臣，赫伯茨。
赫伯茨微微一笑道：“其实呢，现在日本政府的力量并没有我们想象的那样强，他们固然是官方，而且有警察、有自卫队，但是埃博拉的出现已经严重削弱了他们的组织能力，自卫队现在已经处于半解散的状态，就算这次细川护熙的命令得到了贯彻，自卫队想要发兵过来，也不是那么简单的事情。我们的人对于自卫队的一些基地进行了摸查，防守是极为空虚的，而且大部分的自卫官确实已经离队了，只有少部分的人留守在基地里，被禁止外出，他们的军心士气也相当不稳定。
再者说，我们也不需要全面地与日本官方开战，我们完全可以按照自己的策略，在需要的位置上发动攻势。真理军现在可战之军约有三千人，虽然基本上只有轻武器的武装，但是也是一股不小的力量了，妥善使用的话，还是大有可为！”
赫伯茨怂恿麻原彰晃进行起义，自然背后是有齐一鸣的指使的。齐一鸣搞出奥姆真理教这么个玩意儿来，不求把日本搞垮，但是却想让日本伤筋动骨。没有什么比一场莫名其妙的内战更伤的了，即便是真理军的规模不大，但自卫队却同样有埃博拉病毒疫情的影响，难以发挥出十足的战力。日本稠密的城市圈，也使得战斗将主要集中在城市里，巷战将极大地消磨自卫队的力量，同时对于日本已经成熟和发达的经济造成破坏，也将杀伤一定的人口。
如果再算上埃博拉病毒传播造成的死亡，齐一鸣估计弄出一个一两百万的死亡，并不困难。而这么大量人口的损失，再加上经济和各种设施的破坏，对日本造成的创伤将是巨大的。而日本人心理的创伤也将是难以弥合，从而继续消磨日本前进的斗志。
等到中美摊牌的时刻，日本的力量已经不值一哂，而齐一鸣扶植起来的朝鲜联邦，就足以对付他们了。
从这里看，齐一鸣的整个战略模式像一个高度和谐而且复杂的系统，一环套这一环，互相影响而互相加成，他制住远东，统一朝鲜半岛，又祸乱日本，三向使劲之下，东北亚的风云突变，局势大为改观，也造成了中国在西太平洋区域，对美国形成了绝对的优势。
为了支持真理军，齐一鸣甚至不惜拿出了一些了不得的东西。之前得自神秘宫的狂化人血清，赫伯茨假装是自己研发的也献给了麻原彰晃，麻原对此如获至宝。虽然这东西会将人变得人不人鬼不鬼，但是却足够超自然，也足够让普通人惊诧，更显得他们奥姆真理教的特异。
麻原将注射了狂化人血清的真理军战士成为护法金刚修罗，编成特殊的战斗序列，为真理军最核心的战力之一。而一旦爆发了与日本政府的冲突后，这些狂化人，也足以让日本政府在巷战中大吃苦头。