战争结束后，阿戈尔的力量已经非常弱小且分散，阿戈尔中央政府也已经没有了实力再统一各个分部，于是乎，最初的阿戈尔国度解体，变成了一个又一个城邦大小的政体，但他们中的每一个都声称自己是阿戈尔的继承者。
但不管是哪个城邦，他们中的派别和站队依旧是像之前的政府军和起义军一样，对立而又合作着，他们因为意识形态而各自为政，又因为面对深海的共同威胁而并肩作战。
但连统一的阿戈尔都未能做到战胜海怪，这些分散的城邦面对海怪则更是溃不成军，如果按照现在的情况，那整个阿戈尔地区都将很快覆灭。
生死存亡之际，阿戈尔人开始四处寻找求生之道，当他们穷尽一切办法之后，他们终于发现了一条延续阿戈尔历史的道路——深海之力技术，然后他们沿着这条路走了整整一万年至今。
阿戈尔人发现，那个被他们所废弃的深海之力，竟然可以被具象化到新的载体上，使之拥有同样强大的力量，这些承载了深海之力的物什，成为了阿戈尔人新的武器。
就像大地上利用源石的泰拉人一样，阿戈尔人也开始利用深海之力，创造出一个又一个的简单物品，并赋予它们新的意义，阿戈尔各城邦的实力也因此迅速增长。
首先他们建造的就是由巨大透明穹顶所包裹的海底城市屏障，阿戈尔人发现，依靠这层屏障，那些弱小的海怪再也无法入侵他们的家园，而那些强大的海嗣，也可以依靠聚焦屏障的力量尽力去阻挡它们。
最早的屏障强度虽然远远比不上如今阿戈尔的穹顶，但也最后抵御那些不是什么强大的敌人，以透明穹顶为基础的海底城市模板迅速传遍了整个阿戈尔，各个城邦都建立起了属于自己的屏障，在海怪大军的面前得以存活下来。
而后他们又将深海之力应用到了武器上，他们将刀剑赋予力量，拥有力量的刀剑可以轻易斩断海怪的触手，赋予了力量的木棒连打起来都更顺手一些。
由于当时技术的局限性，阿戈尔人并没有开拓出深海之力太多的应用空间，以外人的视角看去更像是在一些原始的兵器上附魔，除了那耐以生存的穹顶以外，似乎没有什么值得关注的技术。
但就是仅凭借着这一点技术，弱小的阿戈尔终于从深海的威胁下存活了下来，被海怪袭击一事，变成了一件小概率事件，由于穹顶的保护，可能一些人一辈子都不会见到一次海怪。
需要说明的是，与现在的海怪和海嗣有所不同的是，当年的海怪因为并没有遭受到太多的阿戈尔各种先进武器的洗礼而过分进化，当初的海怪整体来说并不算很强，即便是海嗣的进化程度也很低，别说是像现在的水月这样进化成人形，很多连一点正常的生物形态都看不出来。
也正是如此，当年并不是太强的海怪让阿戈尔获得了生存的机会，海怪难以入侵阿戈尔城邦的领地，而阿戈尔各部也不再顾及穹顶之外，海怪与阿戈尔人互相井水不犯河水，就这样过了很多年。
期间阿戈尔内部也爆发过非常多次的局部冲突，城邦的消失和重建也是此起彼伏，各个政体依旧在不停轮换，但整个阿戈尔从来就没有统一过，不少人甚至都已经遗忘了阿戈尔这个国度的概念。
几千年内也曾有阿戈尔人离开大洋来到泰拉大陆，尝试与泰拉上的人们交流，但他们发现，千年的隔绝已经让他们彻底无法认同彼此，文化、语言、习俗、认知等等，都已经形同陌路，他们再也不是一路人。
也是因此阿戈尔与泰拉的联系非常少，除了沿海的伊比利亚以外，几乎再也没有其他地区的人知晓阿戈尔。
而在这几千年中，阿戈尔的技术虽然依靠深海之力也有所发展，但总体上来说并没有超过当时的泰拉太多，社会的形态发展也是极其缓慢。
因为那时的阿戈尔并没有变革的契机，他们中的很多人甚至已经忘记了深海之神这回事，也忘记了阿戈尔是直面深海之神第一线的险境，就像当年的拉特兰人忘记了他们曾经的过去一样。
直到两千年前，阿戈尔的历史行进路线再度被改写。
两千年前，深海之神再度降临，深海中的阿戈尔被海浪席卷，无数的穹顶在神强大的力量之下像玻璃一样破碎，浪潮将阿戈尔人卷走，即便是已经适应了水下生存的阿戈尔人，在汹涌的潮水拍打下也难以存活下来。
如泰拉上的人所想，身处祸源中心的阿戈尔，所遭受的损失甚至比被汪洋淹没的伊比利亚还要惨重，毕竟伊比利亚人还能在高山上苟活，而阿戈尔，没有一个地方是安宁的，类比一下，沸腾的海洋就像灼热的空气一样，无时无刻不再折磨着阿戈尔人。阿戈尔，再一次沦陷了。
得益于一万年前神赋予了阿戈尔人的深海之力，虽然阿戈尔人已经自行将其剥离，但残存的一丝力量依旧让他们获得了相较于泰拉人类不俗的水中生存能力，在这场百年浩劫中，他们也坚持活了下来。
但经历了这一次的灾难后，阿戈尔也被彻底改变。
人们再一次回想起了神降临所带来的天灾，以及抹平一切的神力，深海的怪物，撕扯着他们的同胞，自己却又无能为力。
阿戈尔的人口再一次锐减，几千年积攒的文明成果几乎是付之一炬，百年浩劫刚结束时的阿戈尔甚至没有重返故土的伊比利亚国力强大。
好在之前的技术还在，阿戈尔人再一次在海底修建起了穹顶，短短时间内，一个又一个的城邦很快又建立起来，但为了生存，人们现在开始聚集在一起，一个又一个的城邦又以隧道互通了起来，现存的城邦数量甚至还不足原来的十分之一。
城邦的数量减少了，各个城邦间的交流却渐渐多了起来，为了让阿戈尔继续发展下去，他们认为不能再像之前那样各自为政甚至是彼此为敌了。
在浩劫过后五年也就是泰拉前921年，各个城邦的领导层齐聚一堂，经过共同大会一致通过相关决议，所有的城邦决定合并成一个政体，共建一个以阿戈尔人为主体，一致对外的阿戈尔国度，千百年后，统一的阿戈尔再一次出现在了大洋中，由于这是阿戈尔第二次合并建国，因此又叫阿戈尔第二共和国。
经共同大会决定，阿戈尔设立最高政权机关“阿戈尔执政院”，又称议院，执政院由各个城邦选举出来的首领、长者、智者共同构成，称为执政官，又在众执政官中选举一人，负责总管整个议院，职位称呼为统领，执政官与统领在阿戈尔政体中扮演了极为重要的角色。
在第一任统领乌斯凯沃拉上台之际，他就立刻进行了轰轰烈烈的改革，在当时，刚刚建立的阿戈尔新政体还不稳定，在经历了灾难后众人的想法还比较统一，改革的难度不是很大，乌斯凯沃拉凭借着自身所在城邦最为强大的实力和最多的支持，迅速整合了所有城邦和执政官，重新构建了一个新的执政院。
在这个新的议院里，大量的执政官连凳子都还没有坐热就被乌斯凯沃拉所出台的决议革职，由新的执政官取而代之。
在吸取了之前百年浩劫的惨痛教训后，乌斯凯沃拉决定以发展阿戈尔的技术为第一要义，所有的执政官都必须具备良好的科学素养，并全力发展科技以应对阿戈尔可能遇到的各种情况，这在两千年前还是很难实现的，即便是阿戈尔也不是那么容易做到。
除此之外，乌斯凯沃拉制定严格而又富有效率的法律，大幅度调控经济走向，将依靠深海之力发展的技术运用到各处，兴建学院，加强军力以应对可能出现的来自海怪的威胁等等。
虽然在当时执政院里也有很多人对这些决议中的一部分持有异议，但在当时的大环境以及乌斯凯沃拉的强势领导之下，没有人阻挡得了这场改革，科学治国的观念也从此深得阿戈尔民心，那些被革职的人骂他暴君，也没有动摇过他的决心。
有史料记载，曾有一愚者，受某执政官蛊惑冲进议院擅自发布演讲，意图煽动众人颠覆乌斯凯沃拉，而后被乌斯凯沃拉当众一剑刺死，令众人震惊。
乌斯凯沃拉举起沾满鲜血的利剑，对着所有人大喊：“看到了吗？这就是阿戈尔脚下一只聒噪的虫子！”
议院上，无人对其提出异议。
即便他的举动是那么的狂暴，即便一度被人以独裁官的名号称呼，但他依旧获得了大量的支持，不少执政官和群众反而对乌斯凯沃拉的形象感到赞赏，他们认为以现在的情况看只有依靠强硬手段的他才能过将阿戈尔带出困境，走向繁荣。
乌斯凯沃拉的任期长达近三十年，对比之后的阿戈尔统领任期来看，这几乎是一个无法理解的现象，但他却实实在在做到了，乌斯凯沃拉的离任也不是因为败选，而是因为病死在了统领这个职位上，他一生除了执政以外几乎没有其他多余的生活，一生无妻无子，将所有的精力都投入在了阿戈尔上。
在乌斯凯沃拉死后，执政院连忙出台了新的法律《统领法》，严格限制了之后统领的各项权力，连当初支持过他的人们也对此表示了赞成，以保证不会再出现像乌斯凯沃拉这种皇帝一样的情况发生，后人对乌斯凯沃拉的评价也因此变得复杂。
乌斯凯沃拉虽然死了，在他的任期里还有许多的改革没有完成，但由他所构建的阿戈尔框架也开始逐步展现成果，阿戈尔正一步一步顺着他的路线前进，崛起成为一个大国，一个矛盾的大国。