自师徒同心渡难关之后，神医侠女与娇兰、惠芝师徒三人的生活暂时恢复了平静。然而，这份平静并没有持续太久，因为惠芝郡主的身世，一场风波在王府悄然掀起。
一日，惠芝收到王府的邀请，说是王爷想要与她相叙，弥补这些年失散的亲情。惠芝本不想与王府有过多牵扯，但想到毕竟血浓于水，还是决定赴约。
神医侠女放心不下惠芝，便让娇兰陪同惠芝一同前往王府。当她们踏入王府的那一刻，一种压抑的气氛扑面而来。王爷见到惠芝，眼中闪过一丝愧疚与欣喜，但惠芝的神情却始终淡淡的。
宴席间，王爷试图拉近与惠芝的距离，不断询问她这些年的生活。惠芝简短地回答着，不愿多言。这时，王府的管家匆匆赶来，在王爷耳边低语了几句。王爷的脸色瞬间变得阴沉。
原来，王府的一位侧妃突然病重，宫中的御医都束手无策。王爷知道惠芝擅长医术，便希望她能出手相救。惠芝本不想卷入王府的是非，但看到病人生命垂危，医者的仁心还是让她无法坐视不管。
惠芝带着娇兰来到侧妃的房间，经过一番诊断，她发现侧妃是中了一种罕见的毒。这种毒十分刁钻，若不是惠芝医术精湛，很难察觉。惠芝立刻着手准备解毒的药材和方案。
然而，就在惠芝专心解毒之时，王府中却传出了一些流言蜚语。有人说惠芝是为了争夺王府的财产，才故意下毒陷害侧妃，然后再假装救人来博取王爷的信任。
这些谣言传到了惠芝的耳中，她心中十分气愤，但她还是决定先专心救人，清者自清。娇兰则气愤不已，想要去找那些散播谣言的人理论，却被惠芝拦住。
经过几天几夜的努力，惠芝终于成功解了侧妃的毒。侧妃醒来后，对惠芝感激涕零。然而，那些谣言并没有因此而停止，反而愈演愈烈。
与此同时，王府中又发生了一系列奇怪的事情。一些珍贵的物品不翼而飞，王府的账本也出现了错乱。有人将这些事情都归咎于惠芝和娇兰，认为她们是别有用心之人派来破坏王府的。
王爷在压力之下，也开始对惠芝产生了怀疑。惠芝感到十分心寒，决定离开王府。神医侠女得知此事后，立刻赶到王府，为惠芝和娇兰撑腰。
“我的徒弟，我最清楚她们的为人。若有人再敢诬陷她们，休怪我不客气！”神医侠女的威名在江湖上赫赫有名，王爷也不敢轻易得罪。
在神医侠女的帮助下，惠芝和娇兰开始调查这些事情的真相。她们发现，这一切都是王府中的一位幕僚在背后捣鬼。这位幕僚觊觎王府的财产已久，想要通过陷害惠芝和娇兰，来引起王府的内乱，从而达到自己的目的。
惠芝和娇兰在收集到足够的证据后，将这位幕僚的罪行揭露于众。王爷这才知道自己错怪了惠芝，他向惠芝道歉，并表示以后一定会好好保护她。
惠芝虽然原谅了王爷，但她还是决定回到师傅身边，继续钻研医术，悬壶济世。经过这场风波，惠芝也更加坚定了自己的信念，要用医术帮助更多的人。
而娇兰也在这次事件中成长了许多，她的武艺更加精进，同时也明白了人心的复杂。
师徒三人再次团聚，她们知道，未来的路还很长，但只要她们携手共进，就没有什么困难能够阻挡她们