特别调查小队成功封印黑暗力量后，宇宙逐渐恢复了平静。各个星系沉浸在胜利的喜悦之中，联合舰队成为了全宇宙的英雄。然而，在这片欢腾的背后，特别调查小队的成员们却没有丝毫放松。他们深知，这场战斗虽然暂时取得了胜利，但黑暗势力的威胁并未完全消除。
在对封印装置进行全面检查后，科研人员发现了一些令人担忧的迹象。“虽然黑暗力量被成功封印，但封印装置似乎受到了一定程度的损伤。长期来看，可能存在再次泄漏的风险。”首席科研人员向探索队队长汇报。
探索队队长眉头紧锁，说道：“我们必须找到一种方法，彻底修复封印装置，防止黑暗力量再次冲破封印。”于是，特别调查小队开始投入到紧张的研究和修复工作中。
与此同时，在宇宙的一个偏远角落，一群神秘的身影正在秘密集会。他们身着黑色长袍，脸上笼罩着阴影，看不清面容。“联合舰队破坏了我们的计划，但这只是暂时的。黑暗力量的封印并不稳固，我们还有机会。”一个低沉的声音在黑暗中响起。
“可是，特别调查小队一直在关注封印装置，我们很难有机会下手。”另一个身影说道。“哼，那就制造混乱，分散他们的注意力。”那个低沉的声音冷笑道。
不久后，宇宙中开始出现一系列奇怪的现象。一些星系的能量场出现异常波动，导致星球的气候发生剧变，居民们陷入了恐慌之中。联合舰队不得不派出大量力量，前往各个星系进行调查和救援。
特别调查小队也被分散开来，分别前往不同的星系解决问题。探索队队长带领一部分队员来到了一个名为蓝星的星系。这里的能量场波动异常强烈，整个星系都被一层诡异的光芒所笼罩。
当他们进入蓝星星系后，立刻遭到了一群不明身份的机械生物的攻击。这些机械生物身形小巧，但行动敏捷，武器装备也十分先进。“这些机械生物的攻击方式很有组织性，背后一定有人操控。”探索队队长说道。
队员们迅速展开反击，与机械生物展开了激烈的战斗。然而，机械生物的数量越来越多，似乎无穷无尽。在战斗中，队员们发现这些机械生物的能源核心隐藏在身体内部，很难直接攻击到。
“这样下去不是办法，我们必须找到它们的操控者，从根源上解决问题。”探索队队长说道。于是，小队一边抵抗机械生物的攻击，一边寻找操控者的踪迹。
在蓝星星系的一颗荒芜星球上，他们终于发现了一个隐藏的基地。基地周围布满了各种防御设施，想要进入并非易事。特别调查小队能否突破基地的防御，找到幕后操控者，解开星系能量场异常波动的谜团？而此时，其他队员在不同星系又遭遇了怎样的困境？黑暗势力精心策划的阴谋正逐渐浮出水面，特别调查小队再次面临着严峻的挑战。